Primär wirkt Akupunktur über das Zentralnervensystem, welches selbst wiederum auf den Bewegungsapparat, das Hormonsystem und das Herz-Kreislauf-System wirkt.
Die Wirkung hängt dabei von der Art der Störung und der Wahl der behandelten Punkte ab.
Akupunktur verbessert die Durchblutung, fördert eine Ausschüttung von Endorphinen (natürliche schmerzlindernde Hormone des Körpers), lindert Muskelkrämpfe und kann Nerven sowie das Immunsystem des Körpers stimulieren, um eigene Selbstheilungskräfte zu aktivieren.
Mit Hilfe der Akupunkturtherapie soll die Energie ausgeglichen werden, der Energiefluss im Körper wird korrigiert und dadurch wird zur Heilung beigetragen.
Akupunktur wird mit speziellen, sehr dünnen Nadeln durchgeführt und schmerzt kaum. Gelegentlich tritt ein kurzer Schmerzmoment auf, wenn Nadeln an einer besonders sensiblen Stelle die Haut durchstechen, jedoch entspannen sich Tiere in der Regel, sobald die Nadel sitzt.
Alternativ zur herkömmlichen Akupunktur mit Nadeln kann eine Therapie ebenso mit einem speziellen Laser durchgeführt werden. Ein guter Akupunktur-Laser besteht aus einer Handsonde zum Akupunktieren, einem Steuergerät und hat eventuell noch einen Aufsatz für grossflächige Behandlungen. Einfache Geräte, in Größe eines dicken Stiftes bringen meist keine ausreichende Leistung. Dennoch sind solche Geräte haufig anzutreffen.
Bei extremen oder langanhaltenden Schwächezuständen kann zusätzlich eine Moxibustion angebracht sein. Dabei wird Moxakraut (zu einer Zigarre gerollt) angezündet und über ausgewählte Akupunkturpunkte gehalten. Moxakraut gibt eine bestimmte Wärme ab, welche tief in das Gewebe eindringt und dadurch zusätzlich die Punkte stimuliert.